Existen dos mecanismos para la redundancia: varios RNAs de transferencia diferentes pueden transportar el mismo aminoácido, o un tRNA puede tener una base no estándar "tambaleante" en la posición tres del anti-codón, la cual reconoce más de una base en el codón.
Cuando una mutación sinónima o silenciosa ocurre, el cambio se asume a menudo como neutral, significando que no afecta a la aptitud del individuo que lleva el nuevo gen para sobrevivir y para reproducirse.
[8] Muchos organismos, desde bacterias hasta animales, exhiben el uso sesgado de ciertos codones sinónimos.
Este sesgo en el uso de codones puede presentarse por diferentes razones, algunos selectivas y algunos neutras.
Cuando la señal de splicing es destruida por una mutación sinónima, el exón no aparece en la proteína final.