Controlada la provincia por los federales, Lobo permaneció a órdenes del nuevo caudillo, Alejandro Heredia.
Regresó a Tucumán pocos años más tarde, y se puso a órdenes del gobernador federal tucumano Celedonio Gutiérrez, que lo reconoció en su grado de coronel y le dio mando de tropas.
A principios de 1852 participó en la lucha contra el propio Crisóstomo Álvarez desde Bolivia.
Gutiérrez avanzó hacia la Ciudad de Santiago del Estero y la ocupó.
A su encuentro salió el coronel Lobo, que fue derrotado en la Batalla de Tacanitas y murió en combate.