A la mañana siguiente Pedro Quintanar fue informado de los hechos.
Por lo que Quintanar tuvo un primer incidente con Ontiveros a las afueras del pueblo, luego reunió un pequeño grupo y salió en su persecución, al alcanzarlo hubo un breve tiroteo; entonces los militares asesinaron al sacerdote Batis y luego a los restantes.
Quintanar visitó a los soldados capturados y posteriormente los puso en libertad.
Los habitantes de Huejuquilla dieron también muerte al gobiernista Mauricio González cuando huía.
La ocupación duró hasta el día 8, cuando los federales se retiraron a Valparaíso.