El torneo se divide en dos fases: Los 40 equipos participantes son divididos en 4 grupos de 10 equipos a razón de proximidad geográfica.
Los cuatro mejores equipos clasifican a la fase final por el título.
Los 16 equipos clasificados se ordenan según los puntos obtenidos en la fase de clasificación, enfrentándose a visita recíproca de la siguiente manera: Los equipos ganadores de las series serán aquellos que anoten más goles en los dos partidos correspondientes.
Los finalistas del Torneo Apertura y el Torneo Clausura se enfrentarán a un partido en sede neutral de la siguiente forma: Los dos equipos ganadores de estas series ascenderán a Primera División.
Mientras tanto, los equipos perdedores se enfrentarán en otro duelo en sede neutral para definir el tercer ascenso.