Su objetivo fue, a través de dos torneos zonales, obtener el ascenso al Campeonato Nacional B 1989-90, más la posibilidad de disputar un Torneo Reducido para ascender a Primera División.
El torneo consagró a 12 ganadores de las diferentes zonas y estos junto a clubes de la Primera B, accedieron a los Torneos Zonales que otorgaron 2 plazas para participar de la Primera B Nacional.
Sin embargo, en esta última instancia ningún equipo indirectamente afiliado a la AFA ascendió, ya que los ganadores fueron dos de los equipos provenientes de la Primera B (Deportivo Laferrere y Atlanta).
Ambos equipos a su vez, se ganaron el derecho de participar en el Torneo Reducido de Ascenso por una plaza en la Primera División Argentina, sin embargo ninguno de los dos logró acceder a dicha plaza, debiendo disputar la temporada 1990-91 en la Primera B Nacional.
Los 4 vencedores de la fase anterior se enfrentaron entre sí.
Los 2 mejores del grupo se clasificaron al Torneo Zonal.
Los 12 participantes de la Región Sur se enfrentaron a eliminación directa.
Los 2 mejores del grupo se clasificaron al Torneo Zonal.
Fue disputada por los perdedores de la Fase I, los eliminados en semifinales y final se incorporaron en las semifinales y final de esta etapa.
Fue disputada por los perdedores de la Fase I, los eliminados en semifinales y final se incorporaron en las semifinales y final de esta etapa.
Cada zona se disputó a eliminación directa, los 2 ganadores clasificaron al Torneo Zonal.
En caso de empate global, prevalecía dicha ventaja.