Fue representante en África occidental de un fondo de inversión libio, la Libyan African Investment Company (Laico) y representante diplomático para el presidente João Bernardo Vieira.
Llegó segundo en la primera ronda, detrás de Domingos Simões Pereira, líder del Partido Africano por la Independencia de Guinea y Cabo Verde (PAIGC).
Obtuvo el apoyo de varios contendientes para la segunda ronda, incluido el presidente saliente José Mário Vaz, el ex primer ministro Carlos Gomes Júnior y Nuno Gomes Nabiam.
[6] Embaló obtuvo la victoria en las elecciones,[7] sin embargo su rival impugnó los resultados en la Corte Suprema, sin presentar una queja ante la comisión electoral.
[2] Aunque ni la Corte Suprema ni el parlamento habían dado su aprobación para la ceremonia de juramentación oficial, Sissoco Embaló organizó una ceremonia de juramentación alternativa en un hotel en Bisáu para anunciarse como presidente legal del país.