En la temporada 2005-06, se convirtió en director deportivo del Real Valladolid.
En la temporada 2006-07, firmó por el Sevilla F. C. para ocupar el cargo de secretario técnico, en el que permanece durante 7 temporadas, hasta 2013, año que pasó a ser director deportivo del Zenit de San Petersburgo.
En la temporada 2014-15, regresó a España para convertirse en director deportivo del Elche C. F..[1] Desde 2015 a 2017, ocupó el cargo de director deportivo del Middlesbrough F. C. de la Premier League.
En 2020, sería el arquitecto de configurar el equipo que ascendió al conjunto inglés a la Premier League.
[3] El 20 de junio del mismo año volvió al Sevilla F. C. para sustituir a Monchi como director deportivo.