Fue diputado por Cusco desde julio de 1990 hasta el año 1991 tras ser desaforado y posteriormente enjuiciado por el asesinato contra un miembro de la Policía Nacional del Perú.
Zegarra participó como candidato a la Cámara de Diputados representando a su natal Cusco y resultó elegido como diputado, obteniendo 2,938 votos, para el periodo parlamentario 1990-1995.
[2][3] Posteriormente en el año 1991, Vladimiro Zegarra fue desaforado del Congreso de la República y expulsado del partido Cambio 90 tras haber disparado en el abdomen al policía Abraham Román Galiano mediante estado de ebriedad.
[4] Fue luego enjuiciado y condenado por el delito de asesinato.
[1] Pese a haber ejercido brevemente su gestión como diputado, Zegarra percibía una pensión de S/.7,539.