Al mismo tiempo, se desempeñó como Negociador Jefe para la Adhesión de Turquía a la Unión Europea durante el mismo periodo.
Aunque era el ministro turco para la Unión Europea (UE) y también el principal negociador en las conversaciones de adhesión de Turquía a la UE, negó que existiera un genocidio armenio.
También en 2015, criticó al Papa Francisco por incluir el término Genocidio en un sermón que celebró en una misa en la basílica de San Pedro en Roma..[4] Como la UE exigió que Turquía adapte sus regulaciones antiterroristas de acuerdo con las normas de la UE.
Bozkır se opuso a la demanda afirmando que las regulaciones de las leyes antiterroristas ya están en línea con las demandas de la UE.
[6] Armenia, Grecia y Chipre, aunque inicialmente apoyaron, luego decidieron oponerse a la candidatura, supuestamente debido a conflictos diplomáticos.