Los pueblos más cercanos son Sajama unos kilómetros al suroeste y Caripe al noreste de Waña Quta.
El lago es alimentado por las aguas glaciales del nevado Sajama al sureste y el nevado Anallajsi al norte del lago.
El principal desagüe del lago es el río Tomarapi, que sale del lago en dirección noreste y desemboca en el río Cosapa, que a su vez encuentra desemboca en el curso posterior en el Salar de Coipasa.
Hacia el suroeste, en determinadas épocas del año, también se produce un desagüe al río Sajama, que pasa por el pueblo de Sajama hasta el río Lauca, también afluente del Salar de Coipasa.
El lago está ubicado en el Parque Nacional Sajama[2] y es el hogar de aves andinas de alta montaña como la garcilla bueyera, el pato de puna, el pato de cola larga, la avoceta andina, la focha nariguda y el pato rojizo.