En 1901, junto con Karl Pearson y Francis Galton, fundó la revista científica Biometrika.
[1] En principio interesado por la morfología de la mano de Francis Balfour, Weldon reenfocó progresivamente sus intereses científicos hacia los problemas de variación y correlación orgánica.
Comenzó utilizando las técnicas estadísticas desarrolladas por Galton.
En 1900 fue redescubierta la obra de Gregor Mendel, lo que desató un conflicto entre Weldon y Pearson y William Bateson, contrario a los biométricos.
El debate se prolongó intensamente hasta la muerte de Weldon en 1906, aunque la polémica general entre biométricos y mendelianos continuó hasta la fundación de la Síntesis moderna en los años treinta.