William Keith Brooks (* Cleveland, 1848 - 1908) fue un zoólogo y embriólogo estadounidense.
William Keith Brooks estudió en el Williams College y la Universidad Harvard, donde se doctoró en 1875.
A partir de 1876 trabajó en la Universidad Johns Hopkins.
Brooks trabajó especialmente en la anatomía y la embriología de los animales marinos (tunicados, crustáceos y moluscos).
Sus conversaciones con William Bateson al respecto ejercieron una gran influencia sobre este último.