A los 15 años de edad ingresó en un convento benedictino cerca de Lixheim y a los 20 años predicaba en el convento y sus parroquias.
Allí aprendió el idioma hebreo y conoció a Martín Bucero y a Wolfgang Capito.
Al cabo de 17 años de servicio, dejó la ciudad después del Interim de Augsburgo y se mudó a Suiza, donde enseñó teología en Berna desde 1549.
Allí escribió varios comentarios bíblicos y Loci communes sacrae theologiae (Lugares comunes de la sagrada teología), una obra de teología sistemática.
[2] El compositor alemán Johann Sebastian Bach usó el himno de Musculus de 1530, una paráfrasis del Salmo 23, como el texto para su cantata coral Der Herr ist mein getreuer Hirt, BWV 112, que fue interpretada por primera vez en Leipzig en 1731.