Tras estudiar tres cursos académicos (1956-1959) fue enviado como profesor en prácticas a un colegio de la Congregación en San Sebastián, allí fue profesor de Ramón Jauregui.
En 1967 se trasladó a Roma al Centro Internacional Lasaliano, donde mejoró su formación directiva.
Influenciado por el Conclio Vaticano II, desde una perspectiva más acorde con el compromiso social que con una faceta religiosa, Markiegi decidió entrar en la política activa en 1976, como militante de Euskal Iraultzarako Alderdia.
[1] Sustituyó a Mario Onaindia en el Parlamento Vasco (1981), donde permaneció hasta 1994, uniéndose al grupo mixto, en lugar de al Partido Socialista de Euskadi.
[4] Cuando renunció, se reincorporó a la función pública, como asesor en el Consejo Escolar de Euskadi.
En 2002 fue a Marruecos, al ser nombrado director del Instituto Cervantes en Rabat.