Aunque se afirma que es una especie o una variante de estilo vasco de Savate (boxeo francés o kickboxing francés), no está claro si el deporte realmente se originó en el País Vasco.
Se hacen referencias a que Zipota fue empleado por el Basajaun, una figura mitológica vasca, pero hay poca evidencia disponible para esta afirmación.
Algunas personas, como Paul Raymond Buitron sugieren que es un antiguo arte marcial vasco del Viejo Mundo que se desarrolló durante generaciones de inmigrantes vascos en Texas, Estados Unidos.
La falta de evidencias históricas sobre la zipota y el que solo sea practicado en EE.
UU. mientras que en los países vascos francés y español o Euskadi sea desconocido hacen que según algunos críticos el pretendido origen vasco de la zipota se considere una invención de Buitron.