En la citometría de flujo, se suele utilizar para detectar células apoptóticas, debido a su capacidad para unirse a la fosfatidilserina, un marcador de apoptosis cuando se encuentra en la hemimembrana celular externa.
Estas propiedades se han observado en experimentos in vitro.
Se han encontrado anticuerpos dirigidos contra la anexina A5 en pacientes con el síndrome antifosfolípido (APS), una enfermedad trombofílica asociada con una autoinmunidad contra compuestos de fosfolípidos.
En el síndrome antifosfolípidos, la formación del escudo se ve alterada por la interacción de los anticuerpos con la anexina A5.
La anexina A5 se muestra sobrerregulada en el cáncer papilar tiroideo.