Se considera que este apellido está relacionado y puede tratarse de una forma simplificada del apellido Ibarguín o Ibargüen (poco comunes en la actualidad).
[2] Existe también un apellido homónimo de origen judío,[3] procedente del armenio Բարկին (Barkin), y este a su vez del hebreo בַּרקין escrito actualmente como "Barkin", que se encuentra bastante presente en Estados Unidos, en Bielorrusia (en alfabeto cirílico: Баркин), en la Provincia de Esmirna (Turquía) y en su forma hebrea original בַּרקין en Israel.
Dada la similitud de dicho apellido hebreo con el apellido "Barquín", y debido a la presencia del apellido "Barquín" en el Valle del Pas desde el siglo XVIII, unido a la existencia de teorías que sostienen que muchos pasiegos actuales son descendientes de judíos que huyeron de la persecución antisemita procedentes desde otras zonas de España, ha dado lugar a que en ocasiones se le haya atribuido un origen judío-sefardí[4] al apellido "Barquín", cuando en realidad el origen de este es vizcaíno y no judío.
La falacia respecto a la existencia de ese apellido supuestamente sefardí no se sustenta puesto que los no conversos fueron expulsados y los que se convirtieron optaron por cambiar sus apellidos.
Un ejemplo palmario lo constituye el caso del rabí mayor de Castilla que en 1492 tomó el nombre de Fernán Nuñez Coronel y abandonó su nombre original Abraham Seneor y su yerno, que de llamarse Mayr Melamed, pasó a nominarse Fernán Pérez Coronel.