[nota 2] Los jesuitas tuvieron constantes conflictos con soldados y colonos ya que impedían la captura de indios.
Al sur del Biobío grandes concentraciones de mocetones (guerreros) asaltaron a los fuertes más pequeños, asesinado sus guarniciones, y asediaron los mejor defendidos.
[22] La calma parecía restablecida cuando surgió el carismático e inteligente mestizo Alejo como nuevo toqui (cacique) mapuche.
[9] La muerte de Alejo fue celebrada por los españoles, pues produjo tal desconcierto entre los indios que las hostilidades disminuyeron.
[27] Después de su muerte, los butalmapus eligieron a Misqui,[28] su segundo al mando[13][29] y había sido un yanacona.
[12] Había sido elegido por una asamblea de loncos en la que se nombró a Calicheuque como su segundo al mando.
[3][31] También se ha puesto en duda que Molina participara de la campaña, pues su nombre no aparece mencionado en la posterior batalla.
Creyendo que los españoles ya habían cruzado el Laja lo vadeó también por el salto y se encontró con el campamento araucano.
[2] Atacaron por sorpresa a los mapuches en el amanecer, quienes estaban durmiendo o desayunando y no ofrecieron una real resistencia.
Molina deseaba acabar con la guerra, pero para ello debía capturar o matar al toqui, así que organizó una columna de jinetes ligeros para buscarlo.
Un oficial, cuya identidad no fue registrada, sugirió vestir a los jinetes como indios y que marcharan con sus armas ocultas.
Después de un corto viaje llegaron al cerro Guanacas, donde se encontraron con Misqui, quien los confundió con sus guerreros y envió a un emisario para hacerlos llamar para saber por qué habían venido.
El emisario fue amordazado y ocultado en la retaguardia de la columna, que se apresuró en su camino al toqui.
[38] Los fugitivos de la batalla llevaron las noticias por toda la Araucanía y las armas españolas recuperaron su antiguo prestigio.
Se saquearon 396 estancias y 400 000 cabezas de ganado, la mitad de las armas del reino se perdieron junto a los fuertes Arauco, San Pedro, Colcura, Buena Esperanza, Nacimiento, Talcamávida, San Rosendo, Boroa y Chillán.