Capitán Q, conducido por el periodista y aventurero cántabro Quico Taronjí, refleja el día a día de las personas que viven y trabajan en el mar o lo han hecho en el pasado (buceadores, hippies, fareros, policías, médicos, militares...).
Para ello, el presentador debe recorrer un total de 3000 kilómetros por la costa (puertos, playas, acantilados e islas) de España a través de nueve comunidades autónomas: Cataluña, Islas Baleares, Comunidad Valenciana, Región de Murcia, Andalucía, Galicia, Principado de Asturias, Cantabria y el País Vasco.
Todo ello lo hace a bordo un kayak trimarán denominado "Invencible".
[3] Sin embargo, no hay únicamente personas en Capitán Q, ya que también se acerca a la fauna marina para descubrir algunas de las especies que viven en las aguas de alrededor de la península.
Incluso los problemas sociales relacionados con el mar también tienen su cabida en el programa (llegada de pateras que llegan a España por las aguas del Estrecho de Gibraltar, el narcotráfico que llega a través del mar...).