La autonomía universitaria fue conseguida en 1930, por un Decreto Supremo, durante el Gobierno del presidente Gral.
En 1860 el presidente José María Linares funda la primera Academia Nacional de Ciencias.
También se crea el Fondo Nacional de Ciencia y Tecnología (FONDECYT) que se define como el organismo financiero del Sistema Nacional de Ciencia y Tecnología.
[5] CONACYT publica en 1997 un documento titulado "Política, Estrategia y Plan de Mediano Plazo para el Desarrollo de la Ciencia, la Tecnología y la Innovación en Bolivia 1997 - 2002" donde se delinean las estrategias propuestas para ese período.
Allí se forman técnicos superiores en sistemas, construcción civil, electricidad y mecánicas, entre otros.
En 2009 el viceministerio publica el Plan de Ciencia y Tecnología que se centra en cinco ejes:[10] En 1943 se inauguró la estación científica de Chacaltaya, que en 1947 fue ampliada para estudiar física cósmica bajo la dirección del brasileño César Lattes.
Durante los años 1990 la situación continuó con la misma dinámica, incluyendo reducción de personal, hasta que el instituto cerró definitivamente sus puertas en 1997.
La financiación para investigación, desarrollo e innovación en Bolivia proviene de seis fuentes principales: El ámbito principal donde se desarrolla la investigación científica en Bolivia es en el sistema público, que se compone de diferentes organismos e instituciones.