Para favorecer sus propósitos efectuó (desde aproximadamente el 508 a. C.) una reconstrucción fundamental del sistema político ateniense, lo que le llevó a figurar entre los principales legisladores de la antigüedad, cronológicamente después del ateniense Solón.
Así, los miembros de las distintas tribus no tenían contactos personales en su totalidad ni intereses comunes.
[nota 2] Según Aristóteles, fue la Pitia quien designó los diez héroes epónimos de las nuevas tribus atenienses.
Toda la población se dividía también en treinta "tritías" y cada tres tritias formaban una "tribu" (phyle, phylai), existiendo diez tribus.
Los miembros de una misma tribu estaban distribuidos por todo el Ática, es decir, no era una división geográfica.
Era corriente que los políticos, por ejemplo los miembros de la Boulé o bouleutas, fueran elegidos por sorteo.
El sistema opuesto hubiera sido la votación, en que los votantes eligen a "los mejores" (aristoi).
Así, la Ekklesía se convertía definitivamente en el principal órgano de decisión en todos los ámbitos.
Uno de los dos eventos centrales que conduciría a Atenas hacia la democracia plenaria está dado por el hecho de que el diseño institucional impuesto por Clístenes (el segundo evento está dado por Pericles), en cierto modo, configuraba un gobierno en el que se equilibraban componentes democráticos y componentes aristocráticos, no obstante, el componente democrático tenía un perfil más acentuado, porque cuando existían conflictos entre el aréopago y el consejo, la asamblea tenía la última palabra.
Creó también demarcos (...) Con estos cambios, la constitución se hizo mucho más democrática que la de Solón.