La temporada 2006-07 debutó con el Real Madrid Castilla en Segunda, pero no tuvo mucha continuidad.
[4] En Inglaterra, disputó 18 partidos oficiales y dio dos asistencias, pero solo en media temporada porque en diciembre se anunció su vuelta a la primera plantilla del Real Madrid.
Esa temporada 2009-10 fue la de su asentamiento definitivo en la máxima categoría, y como anécdota, en el partido Getafe-Real Madrid, metió un gol a su antiguo equipo con polémica, ya que los futbolistas blancos reclamaron falta de Dani al robar el balón a Casillas, pero luego se demostró que era legal.
Su primera gran actuación esta temporada fue en el partido de la 6.ª jornada frente al recién ascendido Hércules, que terminó con un contundente 3-0 y con una espectacular actuación de Parejo que consiguió el primer gol, dio la asistencia del segundo, y fabricó la contra del tercero.
Unas semanas más tarde, desde Italia llegaron rumores que situaban al jugador en el Palermo, tasandolo en 8-10 millones de euros.
Posteriormente reaparecería contra el Barcelona, jugando los últimos 30 minutos, sin poder evitar la contundente derrota 0-3 ante los culés.
Tras la falta de preparación, notó el cansancio, pero cumplió con creces, ya que en ningún momento se escondió, pedía el balón, distribuía en corto y en largo, y dejó detalles de su calidad, al hacer un "caño" a un jugador rival.
[7] A pesar de todos los rumores finalmente no fue traspasado y permaneció en el equipo en la temporada 2012-13, con Mauricio Pellegrino como entrenador.
Empezó a tener cierta continuidad, tras las lesiones de Éver Banega y Fernando Gago.
Con la llegada del técnico Ernesto Valverde tuvo más minutos y se hizo con el puesto de titular indiscutible.
Su indiscutible presencia en los esquemas de Nuno lo convirtieron en una pieza fundamental en el centro del campo valencianista junto a sus compañeros André Gomes y Javi Fuego.
Tras la dimisión de este, pocos días después se oficializa su renovación hasta 2020 a instancias del técnico Nuno que asumió plenos poderes en el área deportiva.
El público de Mestalla abroncó en varios encuentros a técnicos y jugadores por el pésimo juego del equipo, y los galones que asumió Parejo en la temporada anterior le pasaron factura, unidos a la mejora de su contrato.
Se acordó con el jugador quitarle la capitanía para que así tuviera menos presión y pudiera mostrar su fútbol ya con menos responsabilidad, pero siguió sin recuperar su mejor versión y la afición dudó en varias ocasiones de su entrega.
Con o sin brazalete siguió siendo fijo para todos los técnicos esa temporada, y su rendimiento mejoró cuando Voro tomó las riendas del equipo.
La afición volvió a centrar sus críticas en Parejo que vivía su octava temporada como valencianista.
El partido terminó 1-2 a favor del Valencia, proclamándose campeones de la edición 2018-19.