Thompson asistió a la Escuela de Woodbridge, y sus antecedentes familiares influyeron en su interés por la arquitectura.
La pareja pronto emigró a Montreal en la entonces Norteamérica británica (posteriormente Quebec, Canadá).
Thompson diseñó varias casas, edificios comerciales, tribunales y una iglesia.
Anne's Market, un edificio que sería utilizado temporalmente como el parlamento de Canadá anterior a la confederación.
Diseñó muchos edificios aclamados públicamente, incluidas varias estaciones de tren y almacenes.
El grupo fue el primer complejo completo de edificios ferroviarios del mundo.
La estación fue remodelada varias veces y reconstruida casi por completo en la década de 1980.
Tanto en el puente de Conwy como en el Britannia se utilizó el novedoso diseño tubular ideado por Stephenson.