[1] El suelo que constituye el territorio donde se asienta la ciudad es principalmente proveniente del período cuaternario y antiguamente fue un lago, de esto dan evidencia los humedales que cubren algunos sectores no urbanizados de la sabana.
[3][4] Su río más importante es el río Bogotá, el cual corre a todo lo largo del costado occidental del área urbana y desde hace varias décadas presenta unos altos niveles de contaminación.
Bogotá posee una enorme reserva natural, llamada región del Sumapaz, que en sí misma es más extensa que la propia ciudad, allí está el páramo más grande del mundo ubicado a 3900 m s. n. m. y el parque natural del mismo nombre, además de tres corregimientos, que conforman la localidad número 20 de la ciudad.
También en sus cercanías hay municipios periféricos de fácil acceso desde el centro de Bogotá, como Facatativá, Chia, Cota, Choachí, Tabio, Tenjo, Gachancipá, Sopó, Zipaquirá (donde está la Catedral subterránea de Sal más grande del mundo), Guatavita, Cajicá y Tocancipá (donde se encuentra el Autódromo homónimo y el Parque Jaime Duque).
Esta actividad sísmica genera la creación de una meseta en donde queda ahora ubicada Bogotá, pero por ahora Bogotá se encuentra en lo que se llama una depresión sísmica o semimeseta.