En la actualidad, la batalla de Manzikert es considerada a menudo el momento crucial en el cual los bizantinos perdieron la guerra contra los turcos.
Incluso tras Manzikert, el gobierno bizantino sobre Asia Menor no terminó inmediatamente ni impusieron los turcos fuertes concesiones sobre sus oponentes.
Las reformas de emperadores como Constantino I y Teodosio prolongaron el Imperio Romano pero, sin embargo, se dividió en la mitad oriental y occidental en 395 d. C. La mitad occidental (Imperio Romano Occidental) estuvo plagada de invasiones bárbaras, colapsando en 476 dC mientras que la mitad oriental sobrevivió y comenzó a sufrir helenización transformándose en lo que los historiadores etiquetan hoy como el Imperio Bizantino.
A diferencia de la mitad occidental del Imperio Romano, la mitad oriental experimentó menos invasiones bárbaras, aunque se encontró con los Hunos y Persas, mantuvo a los bizantinos lo suficientemente ocupados como para no hacer intentos de recuperación en Occidente.
Con los éxitos del siglo anterior, el estado bizantino había adquirido más tierras y riqueza.
Esto puso aún más presión sobre la mano de obra necesaria para defender el territorio imperial.
Las facciones se basaban cada vez más en mercenarios, pero estos soldados tan ambiciosos no eran confiables ni tenían leyes.
El Califato Abasí a partir de ahora se convirtió en una simple figura en el mundo islámico.
Los encuentros entre los turcos Selyucidas y los bizantinos no se produjeron hasta después del reinado de Basilio II.
El emperador bizantino Romano Diógenes lideró un ejército en un intento de dar un golpe decisivo contra los Selyucidas y agregar alguna justificación militar a su gobierno (que había visto la pérdida del sur de Italia a los Normandos).
La victoria en sí dio lugar a pocas ganancias en el momento para los turcos Selyucidas , pero el caos civil que dio lugar al Imperio Bizantino permitió que los selyucidas y varios otros aliados turcos invadieran Asia Menor.
Después de Manzikert, los turcos se concentraron en sus ganancias territoriales orientales que fueron amenazadas por la dinastía fatimí en Egipto, aunque Alp Arslan alentó a otros turcos y vasallos aliados a establecer Beyliks en Asia Menor.
Sin embargo, entre 1078 y 1084 la ciudad había estado en manos de Philaretos Brachamios, un renegado armenio.
En 1094, Alejo Comneno envió un mensaje al Papa Urbano II solicitando armas, suministros y tropas calificadas.
En el Concilio de Clermont en 1095, el Papa predicó una Cruzada que debía emprenderse para capturar Jerusalén y, en el proceso, asistir al Imperio Bizantino que ya no podía proteger a la cristiandad del Este de la agresión islámica.
El acuerdo entre el emperador y los cruzados fue que cualquier ciudad bizantina recapturada de los turcos sería entregada al Imperio.
Después de esto, una victoria decisiva en Dorylaeum dio a los cruzados un Asia Menor que estaba abierto al ataque: Sozopolis, Philomelium, Iconium, Antioquía de Pisidia, Heraclea y Cesarea todas cayeron ante los Cruzados y llegaron hasta Cilicia, donde se aliaron con el Reino Armenio.
Desafortunadamente para Alejo Comneno, los bizantinos no pudieron capitalizar completamente estas conquistas, y Cesarea regresó a Selyucidas como parte del Sultanato de Rum junto con otras ciudades como Iconium, la futura capital de los turcos selyucidas.
Con este resentimiento, los Cruzados abandonaron en gran medida la asistencia a los bizantinos contra los Selyucidas y sus aliados.
[1] Durante este tiempo, el Sultanato de Rum estaba ocupado luchando contra sus antiguos aliados, los Danisméndidas.
Juan Comneno pudo usar esto para su ventaja mientras realizaba una serie de campañas en Anatolia y Siria.
Juan dedicó un tiempo y esfuerzo considerables en una serie de campañas en Siria, que enfatizaban su dominio sobre los reinos cruzados locales, especialmente Edesa y Antioquía, pero no dieron como resultado ganancias territoriales a largo plazo para el Imperio bizantino.
[2] Juan II murió en 1143, dejando al Imperio Bizantino un ejército fuerte, importantes reservas de efectivo y un prestigio mejorado.
Sin embargo, la fuerza bizantina fue emboscada en un puerto de montaña con las consiguientes grandes pérdidas para ambos lados.
[7] Sin embargo, la guerra continua tuvo un efecto grave sobre la vitalidad de Manuel; disminuyó en salud y en 1180 sucumbió a una fiebre lenta.
[8] Incluso los Comneno resultaron falibles: Sozopolis, Ankara y Heraclea cayeron ante Kilij Arslan II, cosechando los beneficios de Myriocéfalo por fin.
El débil gobierno imperial bizantino llevó al Reino armenio de Cilicia y Antioquía a liberarse del vasallaje bizantino, este último lo hizo en 1180[9] y el primero estableció al Príncipe León II en el trono en 1187.