El instituto, inaugurado en 1540,[2] fue fundado originalmente como Lateinschule, cambiándose su designación en 1764 a Gymnasium.
En 1780 se trasladó a su histórico edificio en el centro de Weilburgo, diseñado en 1776 al estillo Luis XVI.
En los años 1920 se empezaron a admitir también alumnas, cuya instrucción se realizó en el edificio hoy conocido como el Antiguo Gymnasium, y que en la actualidad alberga la biblioteca municipal y comarcal.
[3][4] En los últimos años el instituto participa regularmente en el concurso escolar del Parlamento Europeo de la Juventud en Alemania, y en 2013 organizó el evento principal del Parlamento Juvenil.
[7] El Gymnasium Philippinum Weilburg es reconocido por sus graduados, muchos de los cuales son conocidos en diferentes ámbitos.