Su madre fue la reina Sinjeong, del clan Pungyang Jo.
Se dice que, el día antes de su nacimiento, ella soñó que le daba a su hijo una caja que contenía un árbol tallado con jade; y el día de su nacimiento un grupo de grullas voló desde la sala del frente y dio vueltas por un largo tiempo.
Por tanto, Heonjeong era el rey pero no tenía control político sobre Joseon, y además cuando alcanzó la edad adulta la reina Sunwon se negó a ceder el control del reino; en 1840 este pasó al clan Andong Kim, la familia de su abuela, tras la persecución anticatólica de Gihae de 1839.
Su segunda esposa fue la reina Hyojeong, elegida por su madre y personas influyentes de la corte.
Durante su reinado, Heonjong construyó el complejo Nakseonjae e insistió en que su concubina Kim Gyeong-bin tuviera el uso exclusivo del complejo, lo que fue una medida sin precedentes en la historia de Joseon.