[12] En 1856, el reverendo Ramón Montsalvatge (enviado por la American Bible Society), llegó a Colombia.
Sin embargo, la denominación creció lentamente y enfrentó persecución religiosa.
Fue solo en 1959 que IPCol adquirió completa autonomía de las denominaciones americanas.
[1][2] En 1982, la denominación creó el Seminario Presbiteriano de la Gran Colombia para capacitar a sus pastores.
Algunos de los miembros se separaron y formaron la Iglesia Presbiteriana en Colombia (Sínodo Reformado).