[1] John comenzó su carrera cinematográfica como aprendiz de los directores Robert Wise y J. Lee Thompson.
[1] Luego hizo su primera película en 1967 filmando The Sergeant (1968) protagonizado por Rod Steiger.
[2] Desde entonces empezó a tener fama por rodar películas de personas duras buscando venganza.
[1] Finalmente Flynn logró llegar a la primera línea de directores con el thriller Rolling Thunder, protagonizada por Tommy Lee Jones y William Devane, el cual es considerado hoy en día un clásico.
[1] Su última película, directa a video, fue Protection (2001) protagonizada por Stephen Baldwin.