[3] Publicó distintos artículos sobre matemáticas durante los siguientes años, y se le atribuye (junto con John Kells Ingram) la introducción del concepto geométrico de la inversión respecto a una circunferencia,[4] en un artículo conjunto.
[5] Posteriormente se ha sabido que Jacob Steiner (en 1824) y Giusto Bellavitis (en 1836) ya habían descrito construcciones similares anteriormente, al igual que Joseph Liouville y, un poco más tarde, William Thomson.
[6] Esta innovación de Ingram y Stubbs quedó destacada en un comentario del matemático John Casey, que la describió como "Una continuación de los primeros seis libros de Euclides, que contiene una fácil introducción a la geometría moderna, con numerosos ejemplos" (4ª edición, 1886);[7] y también quedó reseñada en las Actas del Real Academia Irlandesa en 1845.
En 1845, Stubbs obtuvo su maestría, siendo nombrado miembro del Trinity College y admitido en la orden religiosa, por lo que en adelante centró su atención en los asuntos de la iglesia.
[3] Se había casado con Catherine Louisa Cotter en 1855 y posteriormente la pareja tuvo cinco hijos.