Se desempeñó como secretario de Guerra y Marina en dos ocasiones.
Por su desempeño en esta misión fue ascendido a coronel de infantería permanente y recibió el mando del 2o.
Zona Militar, entabló pláticas con el cabecilla Luis Buli para conseguir la rendición de los yaquis sublevados; sin embargo no tuvo éxito en esta empresa.
El 4 de marzo de 1912 renunció a la citada secretaría y solicitó a Madero quedar al frente de las tropas que combatirían la rebelión orozquista, desatada al iniciar el mes; al día siguiente fue autorizado para cumplir esta tarea y se le encomendó la jefatura de las fuerzas que operaban en Coahuila, Chihuahua, Durango y Zacatecas, para que con ellas combatiera a los insurrectos.
Su muerte conmocionó tanto al presidente Madero como al general Victoriano Huerta, quien vengó su muerte derrotando a Orozco.