Aplastó toda la oposición, incluidas las amargas protestas contra una huelga de tarifas de tránsito en 1983 (la mayoría de los residentes trabajaban fuera del bantustán y dependían del transporte público para ir a trabajar).
Aunque Charles Sebe fue arrestado, escapó de la prisión en 1986 y se dirigió a la cercana Transkei, donde continuó agitando contra el régimen.
En 1987, orquestó el secuestro del hijo de Sebe, Khwane, quien estaba preso en Transkei.hasta que Sebe accedió a liberar a los presos políticos a cambio de su hijo.
Sebe visitó Israel en varias ocasiones durante su presidencia y estableció una oficina comercial en Tel Aviv dirigida por dos israelíes vinculados al movimiento de colonos israelíes Gush Emunim.
Sebe afirmó una vez que Israel había otorgado reconocimiento oficial a Ciskei, aunque el Ministerio de Relaciones Exteriores de Israel lo negó.