La temporada 2016-17 fue la edición número 17 de la Liga Premier de Bosnia y Herzegovina.
Željezničar se coronó campeón.
Los doce equipos participantes jugaron entre sí todos contra todos dos veces totalizando 22 partidos cada uno, al término de la fecha 22 los seis primeros clasificados pasaron a integrar el Grupo campeonato, mientras que los seis últimos integraron el Grupo descenso.
El primer clasificado del Grupo campeonato obtuvo un cupo para la segunda ronda de la Liga de Campeones 2017-18, mientras que el segundo y tercer clasificado obtuvieron un cupo para la primera ronda de la Liga Europa 2017-18; por otro lado los dos últimos clasificados del Grupo descenso descendieron a la Primera Liga de la República Srpska o a la Primera Liga de la Federación de Bosnia y Herzegovina dependiendo a cual de las dos estén afiliados los clubes.
Un tercer cupo para la primera ronda de la Liga Europa 2017-18 es asignado al campeón de la Copa de Bosnia y Herzegovina.