México en la Copa Mundial de Fútbol de 2010

[17]​ Debido a la cancelación del partido, éste fue reemplazado por un amistoso contra Gambia.

[24]​[25]​[26]​ Este hecho causó indignación ya que en ese momento el jugador se encontraba con poca actividad en su club, baja de juego y un evidente sobrepeso.

[37]​[38]​ En el debut, el seleccionado mexicano debió enfrentarse con el equipo africano y anfitrión del campeonato; por temor a ausencias escolares, la Secretaría de Educación Pública permitió a los estudiantes de educación básica ver el partido inaugural entre México y Sudáfrica en sus escuelas.

[39]​[40]​ El partido no fue sencillo para la selección mexicana pues nunca un país anfitrión había perdido en la inauguración de un mundial.

[42]​ El encuentro finalizó con un empate uno a uno; más tarde se enfrentarían Uruguay y Francia empatando a cero goles por lo que la selección mexicana quedó en segundo lugar del grupo, detrás de la selección sudafricana.

[43]​ Se estima que la venta en restaurantes en México fue un 40% mayor a la realizada durante el primer juego de la selección mexicana.

[44]​ El equipo consiguió una victoria histórica ya que por primera vez ganó frente a un equipo que alguna vez fue campeón del mundo en la historia del torneo,[45]​ el marcador fue de 2:0 con anotaciones de Javier Hernández, quien con su anotación consiguió el gol número 2.100 en la historia de copas del mundo,[46]​ y Cuauhtémoc Blanco con un penal.

Reporte El último partido de la primera fase para México fue el encuentro contra Uruguay, donde se disputaba el primer lugar del grupo.

[50]​ En el encuentro, el conjunto mexicano tuvo más tiempo el balón pero menor contundencia en los tiros al arco rival; en el minuto 43, Luis Suárez anotó el gol de Uruguay, que sería el único tanto del partido.

Unas semanas más tarde, apareció en televisión en un comercial del programa Iniciativa México, exhaltando el patriotismo de los mexicanos e invitándolos a que creyeran en su equipo, y asegurando que éste estaba para lograr grandes cosas en la justa mundialista.

En las semanas finales de la concentración, comenzó lo que después se conocería como "Gira Europea".

Durante ella, Aguirre ya tenía casi definida la plantilla de 23 jugadores con los que jugaría el Mundial.

Inclusive, el padre de Jonathan, Geraldo Francisco dos Santos, alias Zizinho, declaró a ESPN que Aguirre era un cobarde, y que su hijo nunca volvería a tomar parte en las convocatorias de la selección mexicana.

Aguirre, además, también fue criticado por haber desaprovechado la totalidad del tiempo que pasaron concentrados los seleccionados nacionales, pues, debido a compromisos comerciales previamente firmados con los patrocinadores de la Selección, los jugadores y el mismo Aguirre, tuvieron que dedicar parte del tiempo de trabajo en grabar comerciales o cápsulas publicitarias.

Igualmente, levantó polémica por haber rotado el brazalete de capitán entre tres jugadores: Gerardo Torrado, Rafael Márquez y Cuauhtémoc Blanco.

Su desempeño fue muy pobre, e incluso corrió, siendo un delantero, menos que el arquero Óscar Pérez, notandose sin condición física y apenas tocando el balón.

Meses más tarde, dio explicaciones, algunas de ellas no muy convincente, del por qué había tomado sus polémicas decisiones.