La MTHFR contiene un grupo flavina enlazado como cofactor y hace uso de NAD(P)H como agente reductor.
[7] La MTHFR también puede ser fosforilada, esto disminuye su actividad aproximadamente en un 20% y permite que sea mucho más fácilmente inhibida por la SAM.
[7][8] La enzima se encuentra codificada por el gen con el símbolo MTHFR ubicado en el cromosoma 1 en los seres humanos, más específicamente en la localización p36.3.
[9] Hay varias variantes en la secuencia del ADN asociada con este gen (polimorfismo genético).
[13] La reacción global catalizada por la MTHFR se encuentra ilustrada a la derecha de este texto.