Hijo de Johann Rudolph Denis, quien le enseñó latín a temprana edad.
A los diez años, fue inscrito para ser educado por los jesuitas en su colegio en Passau.
Dos años más tarde, fue designado profesor en la Academia Theresianum de Viena (un colegio jesuita).
Su Literarischer Nachlass la publicó Joseph Friedrich Freiherr von Retzer en 1802 (2 v.)
Su colección se mantuvo en el Palacio Imperial de Hofburg y fue destruida en el curso de la Revolución de 1848[2] La abreviatura Denis se emplea para indicar a Michael Denis como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.