Museo de la Casa de Gobierno

En 1999 el Poder Ejecutivo designa una Comisión Asesora con el objetivo de crear un museo destinado a albergar parte de la historia democrática del país y que se instalaría en la primera planta del Palacio.

La comisión asesora estuvo integrada por los arquitectos Enrique Benech, Ángel Ayestarán y Fernando Rodríguez Sanguinetti.

[1]​ En sus interiores se encuentran diversas colecciones destinadas a homenajear a la democracia del país en la persona de los presidentes de la República.

[2]​ En el mismo, se encuentran expuestos los cuadros y pinturas de todos los presidentes constitucionales, desde Fructuoso Rivera hasta la fecha.

También se conservan los bustos de los presidentes, las bandas presidenciales e incluso los mobiliarios utilizados en sus respectivos mandatos.

El retrato de la muerte de Venancio Flores se encuentra en dicho museo.