Conocido especialmente por el seguimiento al caso de los jemeres rojos y temas relacionados con Camboya y el Sudeste asiático, Thayer se hizo famoso por ser el último periodista, con el camarógrafo australiano David McKaige, que vio a Saloth Sar, conocido como Pol Pot, y que fue testigo del juicio popular que los jemeres rojos hicieron al antiguo dictador en medio de las selvas del noroeste camboyano en junio de 1997.
Sin embargo, junto con la reportera gráfica Leah Melnick, fueron los primeros periodistas en tener contacto con ambos bandos a principios de los 90.
Thayer llegó a ser el más activo reportero sobre la situación del país indochino, pero sus contactos fueron más cercanos a los jemeres rojos, hasta el punto que muchos críticos le consideran una especie de "portavoz" de estos.
En realidad los jemeres rojos pretendían que los dos periodistas rindieran testimonio del juicio al que iban a someter a Pol Pot por haber ordenado la muerte de Son Sen y 13 miembros de su familia, entre ellos niños y mujeres, ese mismo mes.
Durante dos horas, los dos periodistas presenciaron, grabaron y fotografiaron el juicio popular al que los jemeres rojos sometieron a quien había sido su máximo dirigente.