Esta especie fue descrita originalmente en el año 2013 por los ictiólogos Bárbara Borges Calegari, Pablo Cesar Lehmann-Albornoz y Roberto Esser dos Reis.
[1] La localidad tipo referida es: “Arroyo Harmonia (en las coordenadas: 24°18′19″S 50°36′23″O / -24.30528, -50.60639), afluente del río Tibagi, cuenca del río Paraná Superior), en Telêmaco Borba, estado de Paraná, Brasil”.
[1] Etimológicamente el término genérico Otothyropsis se construye con palabras del idioma griego, en donde: otos significa 'oído', thyris es 'ventana', al estar estrechamente emparentado al género Otothyris; mientras que opsis es lo relacionado con la 'apariencia', por lo tanto, se marca su semejanza a un Hypoptopomatinae.
[2] El epíteto específico biamnicus se construye con palabras en latín, en donde: bi significa 'dos' y amnicus alude sobre ‘habitar en ríos’; de esta manera se hizo alusión al hecho de que esta especie habita en dos cuencas separadas.
Estas características son compartidas con O. polyodon, de la cual se puede diferenciar por presentar más corta la espina en la aleta pectoral y por tener un menor número de dientes en el dentario y en el premaxilar.