Debe su nombre a un haz de banderas que estaban pintadas sobre la puerta de la muralla que da acceso al patio desde la plaza del Triunfo.
En la parte superior está San José con el Niño Jesús en brazos.
[2][3] En la década de 1970 se encontraron en el subsuelo restos arqueológicos de una basílica cristiana que pudiera ser del siglo IV, usada en la etapa romana y visigoda.
[7] En el siglo XIX el pintor Joaquín Domínguez Bécquer (tío del escritor Gustado Adolfo y del pintor Valeriano Bécquer) tenía su taller de pintura en el Apeadero y vivía en una casa del patio de Banderas.
[9] En 2021 la Junta de Andalucía lo consideró como parte integrante del Alcázar.