[5] El nombre genérico masculino «Pogonotriccus» se compone de las palabras del griego «pōgōn, pōgonōs» que sinifica ‘barba’, y «τρικκος trikkos»: pequeño pájaro no identificado; en ornitología, triccus significa «atrapamoscas tirano».
[7][8] Las especies de este género, que exhiben características morfológicas y comportamentales diferenciadas de los Phylloscartes, donde diversos autores las situaban, ya eran colocadas en el presente género por el Congreso Ornitológico Internacional (IOC),[9] así como por diversos otros autores.
(2013) propusieron dividir Tyrannidae en cinco familias, entre las cuales Rhynchocyclidae Berlepsch, 1907 agrupando a diversos géneros entre los cuales Phylloscartes y Pogonotriccus, estos en una subfamilia Pipromorphinae Wolters, 1977, junto a Mionectes, Leptopogon, Pseudotriccus y Corythopis.
[13] El Comité Brasileño de Registros Ornitológicos (CBRO) adopta dicha familia,[14] mientras el SACC aguarda propuestas para analisar los cambios.
[15] Según las clasificaciones del Congreso Ornitológico Internacional (IOC)[9] y Clements Checklist/eBird,[4] el género agrupa a las siguientes especies con el respectivo nombre popular de acuerdo con la Sociedad Española de Ornitología (SEO):[5]