El presidente pro tempore de la Alianza del Pacífico es el máximo representante en eventos internacionales, y lleva a estos las declaraciones y opiniones concertadas del organismo supranacional.
Por lo tanto, el orden lógico de quien asume el cargo es: Chile, Colombia, México y Perú.
En enero de 2023, debido a la crisis política en Perú, el presidente mexicano Andrés Manuel López Obrador decidió no entregar la presidencia pro tempore a la presidenta peruana Dina Boluarte, pese a que correspondía el orden lógico de los países.
Esto se debió a que López Obrador no reconoce el gobierno de Boluarte.
En junio de ese año, México cedió la presidencia pro tempore a Chile, país que en agosto se la otorgó finalmente a Perú, un traspaso acordado diplomáticamente entre los cuatro países miembros.