Originalmente establecido en 1961, el puesto ha funcionado de manera intermitente hasta la actualidad.
Por otra parte, dos personas (Pierre Ngendandumwe y Albin Nyamoya) han ocupado el cargo en dos ocasiones no consecutivas.
En 1972 el presidente Michel Micombero reestableció la oficina, designando a Albin Nyamoya en un intento de calmar las tensiones étnicas.
Para acceder a este puesto, el único requisito es ser de nacionalidad burundesa.
Todo el gobierno, encabezado por el Primer Ministro, debe implementar la política nacional definida por el poder presidencial.