En la tercera temporada Quinn decide recuperar a su hija Beth junto con Noah Puckerman (Mark Salling).
Quinn fue desarrollado por los creadores de Glee Ryan Murphy, Brad Falchuk e Ian Brennan.
Quinn es presentada como la líder del equipo de porristas en la escuela secundaria William McKinley, las "Cheerios", entrenado por Sue Sylvester (Jane Lynch).
Cuando su novio Finn Hudson (Cory Monteith) se une al club Glee, New Directions, Quinn se preocupa por su interacción con la estrella del grupo, Rachel Berry (Lea Michele), y se une a New Directions junto con sus compañeras Cheerios Santana Lopez (Naya Rivera) y Brittany Pierce (Heather Morris).
Quinn decide que el bebé sea adoptado, y acepta dárselo a Terri (Jessalyn Gilsig), la esposa del director del club Glee Will Schuester (Matthew Morrison), quien está fingiendo un embarazo.
Quinn chantajea a Sue para que la deje reunirse con los Cheerios, pero finalmente decide no hacerlo, prefiriendo quedarse con el club Glee, donde se siente aceptada.
Puck nuevamente se ofrece a apoyarla, pero ella lo rechaza y le dice que quiere manejar el embarazo sola.
En el comienzo del nuevo año escolar, Quinn es readmitida como animadora principal.
Quinn no es nombrada reina del baile y culpa a Rachel por su pérdida.
Finn luego rompe con Quinn cuando se da cuenta de que tiene una conexión más profunda con Rachel.
Quinn se da cuenta de que la victoria no significa nada e informan falsamente que los resultados de la reina del baile son una victoria por escrito para Rachel.
Su recuperación es lo suficientemente rápida y más adelante en las Nacionales, baila los números con New Directions que finalmente gana la competencia.
Quinn le está mintiendo porque todavía no quiere que él sepa sobre su pasado.
Quinn en el próximo episodio confirma que es lesbiana y besa a Rachel.
Quinn, Santana y Brittany intentan reclutar nuevos miembros haciendo de Cheerios, pero solo reclutan a los gemelos Mason y Madison cuando la exmiembro de Glee, Kitty, quien fue la única miembro que no fue transferida cuando Sue la vio como una jugadora estrella, anunció que no regresaría por la forma en que Artie la trataba a ella y a todos los demás cuando él se fue.
Ella es mencionada varias veces durante el episodio paralelo al Piloto "2009", como la novia animadora de Finn.
Más tarde se la ve durante la interpretación de Don't Stop Believin viendo la actuación con Sue y Santana.
Ella regresa en los últimos minutos del final de la serie "Dreams Come True" interpretando junto a los demás miembros I Lived en el Auditorio.
Con su buena apariencia sana, Agron ciertamente lució el papel, pero los productores se preguntaron si parecía demasiado inocente.
[10] A la inversa, Bobby Hankinson, del Houston Chronicle, disfrutó a Quinn en el episodio y escribió: "Me encanta que ella pueda mantener su ventaja de Mean Girls mientras está tristemente triste o tan alegre como cuando cantaba Papa Don't Preach".
En algún lugar, Freddie Mercury asiente con orgullo y dice: 'Mundo, te perdono por We Will Rock You'".