Corre en dirección sur - suroeste, recibiendo a su paso varios afluentes menores, destacándose los ríos Portales y Guasimal.
En sus márgenes se asentan importantes poblaciones, tales como Guane, Isabel Rubio, Sumidero y El Moncada.
Esta zona ha sufrido los efectos negativos y no planificados de la acción humana durante el paso de los siglos, ocurriendo deforestación y degradación de la cuenca.
Actualmente se realiza un programa de reforestación y mejoramiento de la zona, organizado por la Delegación Territorial del CITMA, el Centro de Estudios Forestales de la Universidad de Pinar del Río y la Sede Universitaria del municipio Guane, con el apoyo del Servicio Estatal Forestal, dirigido a la rehabilitación de la faja hidrorreguladora del Río Cuyaguateje de interés nacional por su contribución al medio ambiente.
Reforestación de la faja hidrorreguladora del Río Cuyaguateje (Cuba), desde un enfoque social comunitario