Los colegios menores también elegían a su rector (en la práctica era un vicerrector) entre sus colegiales becados.
Ejercía un amplio poder: académico, colegial, económico, judicial y jurisdiccional.
[2] Con el tiempo, este cargo universitario y otros académicos se convirtieron en un trampolín de promoción social.
[3] El proceso electoral consistía en reunir en "capilla" (asamblea) a todos los colegiales el 17 de octubre (el inicio del curso académico en la Universidad de Alcalá era el 18 de octubre, San Lucas) para elegir al rector y a tres "consiliarios" (consejeros o asesores) entre los colegiales mayores.
Deberá dejar transcurrir, al menos, un período de mandato para volver a presentar su candidatura.