[4] El golpe de Estado de 1943 puso fin a la Concordancia y cambió el panorama reinante en la política argentina con el surgimiento del movimiento político que encabezaba el coronel Juan Domingo Perón, y que sería el más popular durante la siguiente década.
Como consecuencia de esto, la UCR Antipersonalista desapareció como una fuerza política nacional y Elena es invitado a reincorporarse nuevamente por la Unión Cívica Radical, junto a algunos otros dirigentes que integraban el radicalismo antipersonalista como Guillermo O'Reilly o Santiago Fassi, quienes también habían desempeñado importantes cargos nacionales en los años anteriores.
En 1960 fue electo como diputado nacional por la Capital Federal, mandato que no pudo completar debido al derrocamiento del presidente Arturo Frondizi a fines de marzo y la subsiguiente clausura del Congreso Nacional decretada por el presidente José María Guido en mayo de ese año.
En su último mandato como diputado nacional, entre 1963 y 1966, Elena tuvo participación en distintos proyectos de ley e incluso presentó uno en el que se cedía los terrenos recientemente ganados al Río de la Plata al Club Atlético Boca Juniors, principal institución deportiva del barrio que manejaba políticamente Elena, para que el club pueda construir su Ciudad Deportiva en la Costanera Sur.
[6] [7] En el año 1972, a fines del proceso político conocido como la Revolución Argentina y con el proceso de apertura democrática que desarrollo el gobierno militar del general Alejandro Agustín Lanusse, Elena sufrió su primera derrota al perder la interna para controlar el Comité Radical de La Boca ante Carlos Bello, padre de la futura menemista Claudia Bello.