Las relaciones entre Colombia y las Filipinas comenzaron incluso antes de que estos territorios se convirtieran en naciones.
Durante un tiempo posterior al establecimiento de los Galeones de Manila, que unían América Latina con Asia, España prohibió el comercio directo entre el Virreinato de Perú, que incluía a Colombia, y el Virreinato de Nueva España, que incluía Filipinas.
Sin embargo, el comercio ilegal entre filipinos y colombianos continuó en secreto, ya que las mercancías asiáticas ilegales terminaron en los mercados de Córdoba (Colombia),[1] debido a la colusión entre comerciantes de filipinos, peruanos y colombianos contra las autoridades en España, ya que se establecieron y comerciaron en cada uno.
Oficiales latinoamericanos de Gran Colombia se encontraban entre los soldados rebeldes que apoyaban a Andrés Novales, el breve emperador de Filipinas, en su breve revuelta contra España.
Relaciones oficiales entre Colombia y Filipinas se estableció en 1959.