El cráter Zucchius está a pocos kilómetros al sur-suroeste, y al noreste se encuentra la inusual formación alargada Schiller.
El cráter más pequeño Weigel está situado al este.
Segner tiene un borde bajo, desgastado, y generalmente mucho menos prominente que el cráter Zucchius cercano.
El suelo se distingue solo por un par de pequeños cráteres y una superficie ligeramente ondulada.
Por convención estos elementos son identificados en los mapas lunares poniendo la letra en el lado del punto medio del cráter que está más cercano a Segner.