Dicho pueblo o barrio comenzó a conformarse una vez finalizada la Guerra Chichimeca, en el siglo XVII.
[6] Durante el siglo XVII, se establecieron en el Barrio de San Marco indígenas tlaxcaltecas, quienes adoraban a la Virgen del Pueblito; es por esta razón que en este templo también se rinde culto a "Nuestra Señora del Pueblito"[7] en una capilla anexa al templo.
La construcción del templo que hoy en día conocemos se debió los curas D. Manuel y D. Mateo José, la causa fue que la capilla antigua se encontraba en pésimas condiciones para dar abasto a la población.
Siendo el señor Manuel de Colón Larreategui quien se propuso a dar al pueblo un templo más amplio.
Los pobladores por su parte ofrecieron su trabajo de manera voluntaria y recaudaron limosnas para la obra.
[8][9] La Guerra Cristera fue una lucha a mano armada donde se enfrentaron creyentes católicos contra militares del gobierno de Plutarco Elías Calles.
La Guerra cristera terminó cuando, en 1935, José Velasco y Plácido Nieto fueron asesinados en el centro de la ciudad.
La fachada principal del templo tiene características barrocas con una distribución a modo de retablo escultórico tallado en cantera; posee tres cuerpos y tres calles con ornamentación sobria, arcos de medio punto y columnas estípite.
[15] Al centro del segundo cuerpo, se encuentra un vitral de la Virgen del Carmen[16] y sobre este, en el tercer cuerpo, se encuentra una escultura de San Marcos tallada en cantera.